Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RTN4Q9NQC3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms