Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEBOXQ9HB31 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms