Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC90BQ9GZT6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC90BQ9GZT6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms