Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SNHG12Q9BXW3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SNHG12Q9BXW3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms