Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM43Q9BTV4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM43Q9BTV4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM43Q9BTV4 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM43Q9BTV4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM43Q9BTV4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM43Q9BTV4 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM43Q9BTV4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM43Q9BTV4 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM43Q9BTV4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TMEM43Q9BTV4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM43Q9BTV4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms