Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MTA3Q9BTC8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MTA3Q9BTC8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms