Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GCNAQ96QF7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms