Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC34Q96HJ3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms