Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSR2Q969E8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSR2Q969E8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms