Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LRRN4Q8WUT4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LRRN4Q8WUT4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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