Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX54Q8TDD1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DDX54Q8TDD1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms