Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZIC4Q8N9L1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms