Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PREX2Q70Z35 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PREX2Q70Z35 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PREX2Q70Z35 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PREX2Q70Z35 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PREX2Q70Z35 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PREX2Q70Z35 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PREX2Q70Z35 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PREX2Q70Z35 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PREX2Q70Z35 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PREX2Q70Z35 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PREX2Q70Z35 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PREX2Q70Z35 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PREX2Q70Z35 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PREX2Q70Z35 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PREX2Q70Z35 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PREX2Q70Z35 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PREX2Q70Z35 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PREX2Q70Z35 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PREX2Q70Z35 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PREX2Q70Z35 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PREX2Q70Z35 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms