Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINGO4Q6UY18 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms