Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
REEP3Q6NUK4 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms