Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GREB1Q4ZG55 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GREB1Q4ZG55 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GREB1Q4ZG55 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GREB1Q4ZG55 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GREB1Q4ZG55 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GREB1Q4ZG55 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms