Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NBPF1Q3BBV0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF1Q3BBV0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms