Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CNPY1Q3B7I2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CNPY1Q3B7I2 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms