Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TWISTNBQ3B726 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms