Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SNCBQ16143 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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