Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA2Q15822 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA2Q15822 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms