Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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PCM1Q15154 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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PCM1Q15154 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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PCM1Q15154 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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PCM1Q15154 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PCM1Q15154 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PCM1Q15154 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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