Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMCO1Q147U7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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