Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNGB1Q14028 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
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