Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SKP2Q13309 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
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