Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AC009446.1-201ENST00000519840 808 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MKRN3Q13064 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MKRN3Q13064 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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