Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF2Q12933 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF2Q12933 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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