Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM1Q08AH1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACSM1Q08AH1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms