Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EGR4Q05215 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms