Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
UBXN1Q04323 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
UBXN1Q04323 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms