Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
DSG1Q02413 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
DSG1Q02413 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms