Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MC1RQ01726 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms