Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRCDQ00LT1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms