Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SKP1P63208 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SKP1P63208 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SKP1P63208 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SKP1P63208 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms