Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
HERVK_113P61574 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms