Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSNK1EP49674 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms