Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASP1P29466 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASP1P29466 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CASP1P29466 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CASP1P29466 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms