Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ATP5F1P24539 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATP5F1P24539 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms