Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK4P11802 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK4P11802 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK4P11802 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK4P11802 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK4P11802 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK4P11802 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK4P11802 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK4P11802 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK4P11802 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK4P11802 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK4P11802 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK4P11802 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK4P11802 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDK4P11802 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK4P11802 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK4P11802 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK4P11802 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK4P11802 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK4P11802 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK4P11802 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK4P11802 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK4P11802 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK4P11802 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK4P11802 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK4P11802 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK4P11802 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK4P11802 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK4P11802 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK4P11802 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK4P11802 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK4P11802 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK4P11802 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK4P11802 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK4P11802 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK4P11802 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK4P11802 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK4P11802 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK4P11802 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms