Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRGAP3O43295 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms