Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ARID3CA6NKF2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ARID3CA6NKF2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms