Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SERINC4A6NH21 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SERINC4A6NH21 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms