Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVW-1Q9UQF0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms