Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CTNND2Q9UQB3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms