Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CGGBP1Q9UFW8 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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