Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
DNAJC28Q9NX36 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
DNAJC28Q9NX36 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms