Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SALL1Q9NSC2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms