Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR33

POLE4, DNA polymerase epsilon subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE4Q9NR33 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
POLE4Q9NR33 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE4Q9NR33 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms