Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB18Q9NP72 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB18Q9NP72 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms