Protein–RNA interactions for Protein: Q99865

SPIN2A, Spindlin-2A, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN2AQ99865 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIN2AQ99865 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPIN2AQ99865 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SPIN2AQ99865 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms